250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2028 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  325  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  35.53 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  29.81 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  31.73 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  30.17 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  29.09 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  30.85 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 352 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  30.49 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  26.36 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  33.33 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1800  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.50534 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>