74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2643 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4547  transcriptional regulator, MarR family  30.87 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  31.95 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2094  regulatory protein MarR  32.64 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4956  transcriptional regulator, MarR family  28.64 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_002950  PG0020  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.965636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 167 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2413  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 158 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3824  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.765459  normal  0.539735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 158 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3697  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4666  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 180 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  32.56 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  25.24 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 152 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  29.76 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 137 aa  45.1  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  29.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  29.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  29.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  29.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  29.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.63 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  23.3 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 135 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  24 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  23.3 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 163 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 142 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 149 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  22.64 
 
 		 148 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  20.3 
 
 		 250 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>