More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7490 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32.14 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  29.69 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  32.73 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 172 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 154 aa  51.2  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  31.96 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  25.23 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  36.25 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  31.96 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 163 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  23.53 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>