81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0092 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  307  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  32.82 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 161 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  21.71 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  21.71 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 134 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1138  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.518739  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  23.2 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 167 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  30.25 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 141 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  30.25 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3783  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3055  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  30.25 
 
 		 143 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 183 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  21.49 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  27.52 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  22.13 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  25.21 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  22.61 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  28.03 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  26.23 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 157 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 158 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>