261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1485 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1485  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
139 aa  273  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252569  normal  0.356309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3344  MarR family transcriptional regulator  55.2 
 
 
134 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  49.07 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  38.64 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  41.84 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.84 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  33.83 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  33.68 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
193 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
303 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
176 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
159 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
176 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
177 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.69 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.69 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.69 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.69 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
169 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
149 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.39 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  36.9 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2643  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
160 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
167 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1072  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885065  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.01 
 
 
312 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  36.26 
 
 
287 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
142 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
135 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
170 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
166 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
157 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.51 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
153 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  41.82 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>