30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1072 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1072  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  37.84 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  36.49 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  31.58 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  36 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 135 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  29.73 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.25 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 166 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>