63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3041 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4273  transcriptional regulator, MarR family  55.97 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  40.45 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  32.23 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2971  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  32.43 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  30.63 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.23 
 
 		 157 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.23 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  23.71 
 
 		 143 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 167 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 182 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 187 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.37 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.67 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  29.23 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 151 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>