20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3789 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  289  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  65 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  63.91 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4641  hypothetical protein  45.59 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 145 aa  47.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2393  hypothetical protein  35.65 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0640  transcriptional regulator Hpr  29.55 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000651656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1457  transcriptional regulator Hpr  29.55 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  32.97 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>