73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1457 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1457  transcriptional regulator Hpr  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0640  transcriptional regulator Hpr  90.55 
 
 
201 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000651656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0960  transcriptional regulator Hpr  75.68 
 
 
185 aa  285  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0812  transcriptional regulator Hpr  76.76 
 
 
185 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.116423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4223  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  284  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00109887  hitchhiker  0.00203511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1081  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  284  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1149  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1122  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1210  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1045  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0955  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0964  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0976  transcriptional regulator Hpr  75.14 
 
 
185 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
158 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
152 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 
172 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 
147 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 
154 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
155 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
155 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
156 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
149 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  27.17 
 
 
154 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
149 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  30.88 
 
 
154 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
155 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  23.53 
 
 
159 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  23.68 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  21.24 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0162  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258521  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0184  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
145 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
171 aa  42.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
153 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
145 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
156 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 
152 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  26.32 
 
 
152 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  24.3 
 
 
166 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
145 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  23.96 
 
 
149 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  23.16 
 
 
153 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
157 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  22.33 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  22.33 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
134 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  29.36 
 
 
150 aa  41.2  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  20.87 
 
 
153 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>