43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0960 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0960  transcriptional regulator Hpr  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4223  transcriptional regulator Hpr  97.3 
 
 
185 aa  348  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00109887  hitchhiker  0.00203511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1081  transcriptional regulator Hpr  97.3 
 
 
185 aa  348  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1149  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0976  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0964  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0955  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1122  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1045  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1210  transcriptional regulator Hpr  96.76 
 
 
185 aa  346  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0812  transcriptional regulator Hpr  94.59 
 
 
185 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.116423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0640  transcriptional regulator Hpr  76.76 
 
 
201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000651656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1457  transcriptional regulator Hpr  75.68 
 
 
205 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 
152 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
155 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
149 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  20.69 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  27.08 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  21.94 
 
 
176 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  25.98 
 
 
160 aa  41.2  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
154 aa  41.2  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
150 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>