28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2971 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2971  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3041  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  36.96 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  39.71 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 153 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.43 
 
 		 310 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 128 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.17 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>