174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0285 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  40.91 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  30.69 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  23.97 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  35.94 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  29.25 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  25.96 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  28.57 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  34.67 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  28.97 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  31.51 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  27.27 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>