64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1786 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1786  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  48.78 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  26.38 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 340 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 326 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 340 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 146 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 208 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 148 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 156 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 146 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  31.96 
 
 		 163 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 157 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  39.34 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  30.7 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 309 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>