61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1389 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  31.63 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  25.78 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  25.89 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 172 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 178 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  26.09 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>