105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1525 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 170 aa  351  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  87.58 
 
 		 161 aa  300  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 162 aa  170  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  28 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  21.32 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  23.47 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  25.66 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  29.63 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  23.74 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 181 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 146 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  28.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 146 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 		 144 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.88 
 
 		 144 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  23.74 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  27.88 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  28.71 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>