196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1361 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  328  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  82.12 
 
 		 156 aa  263  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  80.79 
 
 		 167 aa  254  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  32.98 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  35.62 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  27.82 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  23.77 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  27.45 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  20.44 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.19 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  23.26 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  21.68 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  27.63 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 205 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.34 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 142 aa  43.9  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>