80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1422 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  52.1 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  44.97 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  29.91 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  29.91 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 139 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  26.67 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.21 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  27.97 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 158 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 137 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 292 aa  40.8  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>