32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1376 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1376  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1365  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1520  MarR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 158 aa  254  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.854006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1422  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.40162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1400  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00128815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1389  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000012285  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1264  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1325  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.452176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1525  transcriptional regulator, putative  26.39 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1381  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  23.31 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  29.92 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  23.24 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  25.2 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  22.7 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>