40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01922 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  63.89 
 
 		 313 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 326 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 336 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 326 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 337 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 326 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 321 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 326 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 326 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 325 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.24 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.84 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  34.29 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.88 
 
 		 326 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 314 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 		 848 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.43 
 
 		 322 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 314 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 316 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 308 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.5 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.38 
 
 		 320 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.74 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 		 2151 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.18 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.58 
 
 		 312 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 307 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>