More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2524 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  42.17 
 
 
168 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0331323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2172  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1755  hypothetical protein  30.63 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3196  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.233431  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12684  hypothetical protein  33.77 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  27.63 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  29.29 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  29.29 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  29.29 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  27.74 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  29.29 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3130  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3107  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296377  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0431  Prolyl aminopeptidase  24.32 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20000  acetyltransferase (GNAT) family protein  22.84 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01553  acetyltransferase  29.52 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  27.01 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0707  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0613  hypothetical protein  28.3 
 
 
170 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  26.28 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  32.12 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0680  hypothetical protein  25.58 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2221  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0811  acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0695  hypothetical protein  25.58 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.107584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.54 
 
 
304 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2267  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0656952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
309 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2471  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.583315 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1635  acetyltransferase  22.94 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.964206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432705  normal  0.0282239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
162 aa  57.4  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
172 aa  57.8  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0868  ribosomal-protein-S18-alanine acetyltransferase  35.06 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1148  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.06 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.38 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00161881  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.15 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4721  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3642  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309003  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0302  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.08 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275803  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.3 
 
 
145 aa  54.3  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0900  acetyltransferase  27.07 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
166 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.259985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0897  acetyltransferase  27.07 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
164 aa  53.9  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0188  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.06 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  28.4 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0798  acetyltransferase  29.76 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1574  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  32.58 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3941  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.83 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3290  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.83 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
314 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.096304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1529  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.415207  normal  0.728167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>