220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3441 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  100 
 
 
175 aa  360  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5559  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
173 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000291  putative acetyltransferase  37.93 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06093  hypothetical protein  36.78 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
181 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1925  putative acetyltransferase  37.42 
 
 
180 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
181 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
185 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  36.26 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6402  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
191 aa  84.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4720  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  27.53 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  29.14 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127294  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1982  acetyltransferase  30 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0385879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3347  acetyltransferase  30.99 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00038688  hitchhiker  0.00000000000000505866 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  24 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  25.42 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13780  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.52 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
169 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0821  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  58.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
168 aa  57.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  28.37 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
192 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  28.4 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2229  hypothetical protein  34.57 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00386232  normal  0.484296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3160  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
185 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  26.57 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  24.66 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2681  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  31.36 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  31.31 
 
 
150 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0250  acetyltransferase  27.86 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.416446  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
174 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3579  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
141 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.363377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
212 aa  47.8  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
164 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0405338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  31.13 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  30.95 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  23.56 
 
 
182 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  32 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  23.38 
 
 
547 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1091  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.745657  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  27.73 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0694531  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0493  acetyltransferase  28.86 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  28.28 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0548  acetyltransferase  25.21 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.995158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>