More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2408 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  93.33 
 
 
181 aa  342  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  51.05 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5559  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  39.49 
 
 
175 aa  104  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06093  hypothetical protein  32.94 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6402  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
171 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000291  putative acetyltransferase  31.95 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
171 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
171 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1925  putative acetyltransferase  33.97 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4720  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  28.98 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  26.86 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  29.14 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127294  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  28.48 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  27.89 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
225 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  27.89 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  27.89 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  28.92 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  28.57 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  27.04 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  36.54 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0913  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  28.31 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  27.89 
 
 
161 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0821  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
190 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0250  GNAT family acetyltransferase  34.69 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863666  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7133  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
174 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  22.97 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
169 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  33.03 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1982  acetyltransferase  23.42 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0385879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  29.56 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  29.63 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.07 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  35.37 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  23.94 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3347  acetyltransferase  23.27 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00038688  hitchhiker  0.00000000000000505866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  24 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1085  acetyltransferase  40.98 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000615227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  28.38 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2083  hypothetical protein  22.15 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  47.83 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  29.79 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
157 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
169 aa  48.5  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
177 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
178 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2672  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
152 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.05 
 
 
283 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>