251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3649 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  324  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  67.28 
 
 
216 aa  234  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.728318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  67.28 
 
 
173 aa  234  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1252  GCN5-related N-acetyltransferase  62.96 
 
 
207 aa  226  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216014  decreased coverage  0.00258984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5204  GCN5-related N-acetyltransferase  62.35 
 
 
173 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  59.63 
 
 
186 aa  217  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  62.73 
 
 
173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  60.87 
 
 
175 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2769  GCN5-related N-acetyltransferase  59.63 
 
 
175 aa  208  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  37.82 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
187 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
179 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
197 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
197 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
174 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0811  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 
192 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  33.12 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  35.25 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
171 aa  77  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  35.61 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
183 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  32.84 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  30 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  33.11 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2975  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  35.07 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0267  putative N-acetyltransferase  31.45 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1982  acetyltransferase  30.57 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0385879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1837  hypothetical protein  29.94 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1811  acetyltransferase  29.94 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2015  hypothetical protein  29.94 
 
 
174 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2608e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2083  hypothetical protein  30.57 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1980  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0406169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  31.21 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1794  acetyltransferase  29.85 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000558014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
225 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0105  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
180 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
171 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
171 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0697  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  32.84 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  32.84 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  32.84 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2064  hypothetical protein  31.85 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00611449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4155  acetyltransferase  28.79 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  31.34 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  32.09 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  29.65 
 
 
194 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.89 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  32.09 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  32.09 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
179 aa  57.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  25.36 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611795  normal  0.397187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  31.34 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3347  acetyltransferase  29.11 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00038688  hitchhiker  0.00000000000000505866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  30.6 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0513  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>