154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2776 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
191 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  68.13 
 
 
185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  42.41 
 
 
174 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000291  putative acetyltransferase  31.87 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5559  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  36.55 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06093  hypothetical protein  29.67 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1925  putative acetyltransferase  36.5 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127294  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6402  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4720  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157687  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2415  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00150831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
171 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  31.51 
 
 
172 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
157 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  24.85 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
167 aa  55.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  29.76 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
160 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  23.12 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  45.45 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5716  acetyltransferase  32.84 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0623138 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  33.8 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01553  acetyltransferase  32.47 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0821  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4155  acetyltransferase  27.52 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1837  hypothetical protein  24.84 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1811  acetyltransferase  24.84 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1794  acetyltransferase  24.84 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000558014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
169 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2015  hypothetical protein  24.84 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2608e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1980  hypothetical protein  24.84 
 
 
173 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0406169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0105  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0408298  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0086  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2083  hypothetical protein  24.34 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0937  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  37.08 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  22.88 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0697  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
165 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
169 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  36.52 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2240  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0267  putative N-acetyltransferase  27.69 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2926  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.834032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  36.52 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03210  acetyltransferase  29.01 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17910  acetyltransferase  29.87 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.501427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2339  GCN5-like N-acetyltransferase  28.81 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00797251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  28.48 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>