182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3521 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  38.01 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
169 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 
172 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
169 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  33.73 
 
 
174 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3347  acetyltransferase  30.59 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00038688  hitchhiker  0.00000000000000505866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1982  acetyltransferase  31.58 
 
 
178 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0385879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
178 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
183 aa  89  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0267  putative N-acetyltransferase  34.46 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0697  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2083  hypothetical protein  27.65 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2064  hypothetical protein  27.65 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00611449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0105  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1837  hypothetical protein  26.04 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1811  acetyltransferase  26.04 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1794  acetyltransferase  26.63 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000558014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1980  hypothetical protein  26.04 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0406169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2015  hypothetical protein  26.04 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2608e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2975  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2487  acetyltransferase  29.61 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2415  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00150831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4155  acetyltransferase  26.79 
 
 
168 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  26.51 
 
 
171 aa  61.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  26.51 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  28.33 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611795  normal  0.397187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 
164 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.57 
 
 
547 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  27.97 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
162 aa  54.3  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  24.65 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  34.73 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
202 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00258102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  37.37 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5559  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
173 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  23.9 
 
 
164 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  31.13 
 
 
161 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  31.13 
 
 
161 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  30.56 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  32.43 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1029  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0493  acetyltransferase  32.17 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  32.43 
 
 
161 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13780  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.37 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  32.43 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2769  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>