82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2229 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2229  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  363  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00386232  normal  0.484296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  40.8 
 
 
197 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25320  acetyltransferase (GNAT) family protein  42.86 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0377925  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5818  GCN5-related N-acetyltransferase  41.99 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87476  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23330  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.11 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0189427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2232  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
189 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3160  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  36.25 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  35.75 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3313  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114545  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2469  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.59 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1029  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4712  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  24.4 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
170 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  25.44 
 
 
170 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  24.4 
 
 
171 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.64 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
172 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  31.95 
 
 
547 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00258102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2144  hypothetical protein  30.41 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  34.57 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
188 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.728318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
179 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1252  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
207 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216014  decreased coverage  0.00258984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  22.58 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
171 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
175 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
168 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  30.41 
 
 
174 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
157 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5204  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  29.27 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  24.22 
 
 
172 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2769  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2933  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0253991  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0913  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
168 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0811  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
179 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
168 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  20.61 
 
 
165 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
168 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0513  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
168 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  23.12 
 
 
174 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  22.81 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>