72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2144 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2144  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  75.74 
 
 
202 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00258102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3313  GCN5-related N-acetyltransferase  53.2 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  42.13 
 
 
194 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  40.4 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.68692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2232  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 
189 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3160  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1384  GCN5-related N-acetyltransferase  39.25 
 
 
193 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.87476  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
197 aa  94.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
183 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23330  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.64 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0189427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1029  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  23.03 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  19.5 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2469  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.89 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  22.47 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
171 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  28.72 
 
 
547 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5818  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  22.4 
 
 
174 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  24.47 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  25.84 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
170 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  26.63 
 
 
170 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  22.16 
 
 
184 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25320  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.65 
 
 
193 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0377925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  25.65 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
162 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  20.32 
 
 
167 aa  48.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  24.7 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  25.13 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
174 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 
168 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 
182 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  20.99 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.728318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  22.96 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  22.96 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
173 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
423 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.711331  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611795  normal  0.397187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  22.05 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  30.3 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.08 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  19.75 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
173 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.76 
 
 
148 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  21.54 
 
 
174 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
183 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  23.56 
 
 
168 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1085  acetyltransferase  29.58 
 
 
159 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000615227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  22.91 
 
 
174 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5204  GCN5-related N-acetyltransferase  23.63 
 
 
173 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1252  GCN5-related N-acetyltransferase  23.89 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216014  decreased coverage  0.00258984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
251 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0382  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
166 aa  41.2  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.179689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>