193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0611 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  91.21 
 
 
183 aa  345  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  93.45 
 
 
180 aa  303  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0105  GCN5-related N-acetyltransferase  91.07 
 
 
180 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0267  putative N-acetyltransferase  89.88 
 
 
169 aa  295  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0697  GCN5-related N-acetyltransferase  91.07 
 
 
169 aa  294  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  90.48 
 
 
169 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  65.19 
 
 
183 aa  247  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1026  GCN5-related N-acetyltransferase  56.29 
 
 
168 aa  195  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0584  GCN5-related N-acetyltransferase  52.69 
 
 
174 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.77246  normal  0.308208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3229  GCN5-related N-acetyltransferase  55.09 
 
 
168 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
168 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
168 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
168 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
168 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2975  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
168 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.611795  normal  0.397187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 
168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  44.24 
 
 
168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3652  GCN5-related N-acetyltransferase  49.39 
 
 
168 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390666  normal  0.0966919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4155  acetyltransferase  44.31 
 
 
168 aa  147  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1756  FR47 domain protein  39.63 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
172 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2083  hypothetical protein  26.88 
 
 
174 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000771457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2064  hypothetical protein  25.62 
 
 
173 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00611449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000138453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1837  hypothetical protein  25.62 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1811  acetyltransferase  25.62 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1794  acetyltransferase  25.62 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000558014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2015  hypothetical protein  25.62 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2608e-43 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1252  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216014  decreased coverage  0.00258984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.728318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1980  hypothetical protein  25.62 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0406169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1982  acetyltransferase  25 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0385879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5204  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3347  acetyltransferase  25 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00038688  hitchhiker  0.00000000000000505866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3897  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2567  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.864557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3602  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  33.09 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  29.56 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2769  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1387  acetyltransferase  31.47 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  28.26 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
165 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  33.12 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5509  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
195 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244703  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
166 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
188 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2473  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1091  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.745657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4132  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0377021  normal  0.0305301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0789  hypothetical protein  27.21 
 
 
194 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
202 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00258102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  26.06 
 
 
547 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.43 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  27.15 
 
 
161 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.777166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  23.38 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
323 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  22.46 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2814  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0634  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.581796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>