67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1952 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1952  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 192 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1363  GCN5-related N-acetyltransferase  82.01 
 
 		 222 aa  316  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1709  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.674932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4635  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  0.0800647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.74 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.31 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34630  acetyltransferase  28.02 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 308 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 167 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.87 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  31.09 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3711  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 307 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.62 
 
 		 312 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 307 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  43.86 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05970  acetyltransferase  31.31 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.410057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  39.47 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.86 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.21 
 
 		 310 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 		 162 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.43 
 
 		 304 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 309 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 320 aa  44.7  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  26.09 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.57 
 
 		 308 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  37.5 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 		 418 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.400224  hitchhiker  0.00548732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 907 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3123  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.63 
 
 		 326 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  26.09 
 
 		 319 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  24.44 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  32.14 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 159 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 159 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.2 
 
 		 305 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 310 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2582  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  33.75 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>