More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3592 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3592  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.568766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  54.93 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.73 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 185 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  49.64 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  50.72 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  53.12 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  56.93 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  43.95 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  47.83 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  47.83 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  49.65 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  57.26 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  57.27 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  52.55 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  54.68 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  53.98 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  56.03 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  48.94 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  48.94 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  53.08 
 
 		 144 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  48.2 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  47.9 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  56.64 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  47.9 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  48.18 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  51.52 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  48.51 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  56.52 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 166 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  47.26 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  45.32 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  50.43 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  43.51 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 166 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>