201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1940 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1940  regulatory protein MarR  100 
 
 		 165 aa  318  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  36.61 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4041  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.14 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  30.97 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.71 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0651  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal  0.369973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  34.48 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  31.93 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.55 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  25.37 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.29 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  29.21 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  31.31 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.75 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  35.82 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  35.82 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  35.82 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>