67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1846 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1846  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2290  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 146 aa  163  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000698981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2332  regulatory protein MarR  51.41 
 
 		 146 aa  163  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  25.2 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0946  MarR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  20.16 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  36.25 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  27.82 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  24.39 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  28.1 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  23.03 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 340 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 340 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  21.9 
 
 		 166 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 138 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  25.77 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  29.25 
 
 		 319 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>