87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2268 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2268  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 159 aa  326  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002615  transcriptional regulator MarR family  33.77 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03391  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0180  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 411 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  30.43 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  33.73 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.37 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.34 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  38.6 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  36.11 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  30.1 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  24.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 151 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  37.74 
 
 		 158 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 174 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.43 
 
 		 172 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 161 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 168 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  34.55 
 
 		 142 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 165 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 141 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  31.11 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30.21 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  31.58 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>