32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4223 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  56.18 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  50.56 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  50.55 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  45.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  48.91 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  43.68 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  41.94 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  45.05 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  36.46 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  42.22 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  40.43 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  36.26 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  34 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  33.71 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  37.84 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  30.93 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 872 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  32.98 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  23.16 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>