53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  191  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  54.26 
 
 
103 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  53.19 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  46.74 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  45.74 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  44.09 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  43.18 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  43.01 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  43.96 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  45.16 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  43.53 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  47.13 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  36.96 
 
 
112 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  58.18 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  40.51 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  40.48 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  35.16 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  35.63 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  32.14 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  36.56 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  36.05 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  31.25 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
103 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
326 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  34.78 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  36 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  29.79 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  36.96 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 
332 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  29.89 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
103 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  30.11 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  32.18 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  40.85 
 
 
121 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 
325 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
303 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  44.19 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  28.74 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  26.44 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  30.68 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 
330 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  32.95 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>