30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2286 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2286  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
146 aa  281  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
173 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
162 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4346  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.11 
 
 
176 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
144 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>