More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1243 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1243  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
153 aa  288  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0356088  normal  0.548993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  47.71 
 
 
151 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  39.39 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  39.6 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 
148 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 
148 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  28.44 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  33.77 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
178 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.9 
 
 
167 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.2 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  36.59 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
207 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  36.71 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
155 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
148 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
178 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 
150 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  31.16 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>