108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0139 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  53.98 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  53.1 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  57 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  45.69 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  27.37 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  27.37 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  27.37 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.36 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  40.24 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  30.12 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  27.37 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  27.37 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  41.89 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 171 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 322 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 150 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 151 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 146 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  26.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.72 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  47.06 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>