107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0418 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  77.88 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  42.06 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  41.12 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  35.78 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.47 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  31.88 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 320 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 326 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 340 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 340 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.12 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.49 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  50 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  27.83 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  28.74 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  28.57 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 150 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 174 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>