266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0946 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0946  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  313  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  32.98 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  28.17 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  27.46 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.63 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.63 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  32.22 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  28.43 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  26.88 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
267 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29.79 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  26.26 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  26.53 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  24.66 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  29.79 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  27.45 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  25.53 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  24.65 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>