More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1731 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
141 aa  279  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  74.26 
 
 
139 aa  201  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
159 aa  167  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
159 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
159 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
159 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
159 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  64.62 
 
 
159 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  63.85 
 
 
159 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  67.69 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  67.69 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  67.69 
 
 
139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  57.25 
 
 
144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  63.41 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  37.96 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5857  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0150711  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
340 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
326 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
340 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  33.75 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  33.75 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.75 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.75 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.5 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
347 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
138 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.77 
 
 
349 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
349 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
347 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  32.11 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
157 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
320 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  32.77 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
309 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  20.41 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.78 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  20.41 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  20.59 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  27.84 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  39.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  27.84 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  27.84 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  34.18 
 
 
214 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28.43 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
322 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
142 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
142 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
142 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
205 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 
142 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
151 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28.7 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.96 
 
 
292 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>