More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5295 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5295  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  316  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  38.68 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  37.17 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  38.94 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  39.8 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  37.17 
 
 		 137 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  43.24 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  38.89 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  45.07 
 
 		 292 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  39.77 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  44.44 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  41.03 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>