20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1297 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1297  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  309  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0524  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0172488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3369  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0203998  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  30.94 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 192 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 192 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>