166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0053 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 163 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  44.09 
 
 		 152 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  40.16 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2578  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.856924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2623  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0922619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 153 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 146 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 146 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  37.21 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  28.89 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  40.54 
 
 		 144 aa  44.7  0.0009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  38.27 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.5 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  36.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  36.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  42.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2926  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  39.19 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>