117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6002 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  63.38 
 
 
155 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  64.47 
 
 
168 aa  177  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6619  MarR family transcriptional regulator  60.99 
 
 
158 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2306  transcriptional regulator, TrmB  53.85 
 
 
141 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 
147 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  22.67 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  22.67 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
128 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.04 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.3 
 
 
140 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  31.43 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.34 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  33.66 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  29.07 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  22.88 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  22.88 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
143 aa  44.3  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
143 aa  43.9  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  30.51 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  34.72 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  23.3 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
191 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
145 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.61 
 
 
325 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 
147 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  22.31 
 
 
160 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1998  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>