84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2306 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2306  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  57.04 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  59.23 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6619  MarR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  23.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30 
 
 		 318 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  31 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.26 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  30.84 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 187 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 158 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  25.64 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.26 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  30.7 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 296 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  26.85 
 
 		 287 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 148 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 151 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>