206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6619 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6619  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  303  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  60.99 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  61.43 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  66.67 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2306  transcriptional regulator, TrmB  54.2 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  36.7 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  41 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  36.08 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.87 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  25.77 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1786  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  34.58 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  39.56 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.68 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  31.88 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  24.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  24.1 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 325 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0585  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  35.64 
 
 		 292 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  24.47 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2219  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  23.4 
 
 		 154 aa  43.9  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  22.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>