64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0585 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0585  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 180 aa  339  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  37.98 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  32.69 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 149 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  30.43 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 157 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 169 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 140 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  32.48 
 
 		 161 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 191 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 145 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  28.83 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 139 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>