More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0342 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  299  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  94.56 
 
 		 147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  94.56 
 
 		 147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  40.32 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  36.11 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.6 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.03 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.03 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5325  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  35.94 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  36.76 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  37.1 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 178 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1032  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  36.09 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 161 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 155 aa  95.9  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  36.22 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  38.93 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  35.04 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  37.59 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 163 aa  94  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  35.48 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 172 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 166 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  35.34 
 
 		 143 aa  93.2  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  42.02 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.34 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>