43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4788 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  259  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  78.64 
 
 		 192 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  78.64 
 
 		 192 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  79.79 
 
 		 198 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 193 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 174 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 168 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  36.11 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.87 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.17 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  32 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  30.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  37.93 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.43 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 167 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 147 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  30 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.08 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.08 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 146 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 155 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>